Nom assez courant en Gascogne, à travers de multiples variantes : Collonges, etc...
Viendrait de "colonia" ?
"Calònjas" est la forme proposée par BBF (Bénédicte Boyrie-Fénié) dans son dictionnaire des noms de communes du Lot-et-Garonne. On pouvait hésiter entre "Calònjas" (à prononcer "Calonjos") et "Calonjas" (à prononcer "Calounjos")...
Et puis, même le "s" final, était-il étymologique ou un simple ornement graphique ?
Suivons BBF qui a fait un travail sérieux sur le terrain et dans les archives !